De tentoonstelling De Verdieping van Nederland biedt een blik op goed bewaarde geheimen uit de geschiedenis. Veel Nederlanders weten dat New York ooit van Nederland was, of dat Willem van Oranje is vermoord. Weinigen weten echter dat daar ook tastbare bewijzen van bestaan.

Op de permanente expositie, die regelmatig van samenstelling wisselt, zijn die topdocumenten te zien. Zo kunnen mensen er naar de documenten van Ratificatie van de Vrede van Münster of de enige uit de Middeleeuwen overgebleven handgeschreven tekst van de Marialegende Beatrijs kijken.