Peter Berend Dirksen werd geboren op 29 oktober 1928 in Doetinchem. Hij studeerde theologie in Leiden en werd in 1963 hervormd zendingspredikant (docent Oude Testament aan het Koptisch-Evangelisch Seminarie in Caïro, Egypte). In 1977 werd hij godsdienstleraar te Leiden en in 1981 universitair docent Oude Testament in dezelfde plaats. Hij promoveerde op een proefschrift over de zogeheten Peshitta-manuscripten van het boek Richteren en was ook directeur van het Peshitta-instituut in Leiden, waar men onderzoek deed naar de oud-syrische Peshitta-handschriften.

Dirksen ging in 1993 met emeritaat.